Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms