Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms