Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5934D3Z4U6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms