Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9630041A04RikD3Z3U4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms