Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms