Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms