Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kif28pD3YXS5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms