Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms