Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms