Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfap1bC0HKD9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfap1bC0HKD9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms