Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmf1B9EKI3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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