Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppfia4B8QI36 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia4B8QI36 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia4B8QI36 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia4B8QI36 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia4B8QI36 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms