Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20547B8JJN0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
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Gm20547B8JJN0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm20547B8JJN0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm20547B8JJN0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20547B8JJN0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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