Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms