Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms