Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms