Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms