Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdc2B2RR83 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdc2B2RR83 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc2B2RR83 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms