Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms