Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b1B1AZQ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b1B1AZQ8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms