Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms