Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms