Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem235B1AQL3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Tmem235B1AQL3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem235B1AQL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms