Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox1B1APN4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhox1B1APN4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms