Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm11127A7VMS2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm11127A7VMS2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11127A7VMS2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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