Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms