Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll11A4Q9F4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms