Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll3A4Q9E5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll3A4Q9E5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms