Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms