Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp8b5A3FIN4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms