Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trgv2A2J008 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms