Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms