Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms