Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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