Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin3aA2AIR5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin3aA2AIR5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms