Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myom3A2ABU4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms