Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprfA2A8L5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms