Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc27A2A6Q5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms