Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms