Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms