Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
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