Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms