Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms