Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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