Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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