Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.29■■□□□ 1
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