Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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