Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5S6

Ighv3-1, Immunoglobulin heavy variable 3-1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-1A0A075B5S6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv3-1A0A075B5S6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv3-1A0A075B5S6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv3-1A0A075B5S6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv3-1A0A075B5S6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv3-1A0A075B5S6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv3-1A0A075B5S6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv3-1A0A075B5S6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv3-1A0A075B5S6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv3-1A0A075B5S6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv3-1A0A075B5S6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv3-1A0A075B5S6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv3-1A0A075B5S6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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