Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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