Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SP140Q13342 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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